כרומטוגרפיה של ג'ל, המכונה גם סינון ג'ל, בכימיה אנליטית, טכניקה להפרדת חומרים כימיים על ידי ניצול ההבדלים בשיעורים שבהם הם עוברים במיטה של חומר נקבובי וחצי מוצק. השיטה שימושית במיוחד להפרדת אנזימים, חלבונים, פפטידים וחומצות אמינו זה מזה ומחומרים בעלי משקל מולקולרי נמוך. הפרדת רכיבי התערובת באמצעות כרומטוגרפיה של ג'ל מבוססת על ההבדלים בגדלים המולקולריים של הרכיבים. מולקולות קטנות נוטות להתפזר אל פנים החלקיקים הנקבוביים כך שהזרימה שלהם מוגבלת, בעוד שמולקולות גדולות אינן מסוגלות להיכנס לנקבוביות ונוטות לזרום ללא הפרעה. לפיכך, המרכיבים במשקל המולקולרי הגבוה ביותר משאירים את המיטה ראשונה, ואחריה מולקולות קטנות בהדרגה. חומרי המיטה הנמצאים בשימוש נרחב ביותר הם פוליאקרילאמיד ופולימר שמכינים מדקסטרן ואפיקלורוהידרין. הפולימרים היבשים מושעים בדרך כלל בחומרים מתאימים ליצירת תערובת הומוגנית וחצי מוצקה.
