רפורמה מנהלית
ממשלות הודיות קודמות נחלשו על ידי שתי נטיות שהתפרקו האופייניות למדינות קדומות - האחת מהצבאות התפצלה לכוחות הפרטיים של מפקדים בודדים והשנייה של מושלים מחוזיים הופכים לשליטים מקומיים תורשתיים. אכבר נלחם במגמות הללו על ידי הנהלת רפורמות מקיפות שהיו מעורבות בשני שינויים מהותיים. ראשית, כל קצין מונתה, לפחות לפחות באופן עקרוני, על ידי הקיסר וקודם במקום על ידי הממונה המיידי שלו. שנית, ההפרדה המסורתית בין אצולת החרב לזו של העט בוטלה: למנהלים אזרחיים הוטלו דרגות צבאיות, וכך הפכו תלויים בקיסר כמו קציני הצבא.
דרגות אלה דורגו באופן שיטתי ממפקדים של 10 איש למפקדים של 5,000 איש, כאשר דרגות גבוהות יותר הוקצו לנסיכי מוגול. לקצינים שולם או במזומן מקופת הקיסר או, בתדירות גבוהה יותר, על ידי הקצאת קרקעות מהן נאלצו לגבות את ההכנסות, תוך שמירה על גובה משכורתם והעברת היתרה לאוצר. נראה כי אדמות כאלה הועברו לעתים קרובות מקצין אחד לשני; זה הגביר את התלות של הקצינים בקיסר, אך יתכן שהוא גם עודד אותם לסחוט ככל האפשר מהאיכרים איתם הקשר שלהם עלול להיות חולף. מבחינה פוליטית, הכשרון הגדול ביותר של המערכת היה בכך שהיא מאפשרת לקיסר להציע קריירה אטרקטיבית לבעלי יכולת, שאפתנות ומשפיעות. בכך הצליח אכבר לגייס את שירותיהם הנאמנים של נסיכי רג'פוט רבים.
הרפורמות של אכבר דרשו מערכת פיננסית ריכוזית, וכך, לצד כל מושל מחוז (סאבדאר, לימים נאוואב) הוצב מנהל אזרחי (דיוואן, או דיוואן) שפיקח על גביית הכנסות, הכין חשבונות ודיווח ישירות למנהל קיסר. כאמצעי הגנה נוסף מפני שימוש לרעה, אקבר ארגן מחדש את רשת כתבי החדשות הקיימת, שתפקידה היה לשלוח דיווח קבוע על אירועים חשובים לקיסר. כמו כן נראה כי אכבר הנהיג הערכת וגביית הכנסות יעילות יותר במאמץ להגן על האיכרים מפני דרישות מוגזמות והמדינה מפני אובדן כסף. אולם ניתן היה לאכוף יעילות כזו רק באזורים המנוהלים ישירות על ידי השלטון המרכזי. זה הדיר את האדמות תחת שליטי יובל כמו הראג'פוטס וגם את האדמות שהוקצו לתחזוקת קציני מוגול.
עם זאת, על אף הרפורמות של אכבר, חשבונות המטיילים מצביעים על כך שהאיכרים ההודים נותרו מרוששים. האליטה הרשמית, לעומת זאת, נהנתה מעושר רב; חסות ליברלית ניתנה לציירים, משוררים, מוזיקאים ומלומדים, ותעשיות יוקרה פרחו. עקבר תמך גם בסדנאות מדינה לייצור טקסטיל וקישוטים איכותיים.
