ג'ון פילופונוס, המכונה גם ג'ון הדקדוק, יואן פילופונוס היווני או ג'ואן גרמטיקוס, (פרח המאה ה -6), פילוסוף נוצרי, תיאולוג וחוקר ספרות שכתביו ביטאו סינתזה נוצרית עצמאית של המחשבה ההלניסטית הקלאסית, אשר בתרגום תרמה לסורית וערבית תרבויות ולחשיבה מערבית מימי הביניים. כתיאולוג, הוא הציע השקפות אזוטריות מסוימות על הדוקטרינה הנוצרית של השילוש הקדוש ועל טבעו של ישו.
יליד אלכסנדריה במצרים, ותלמידו של הפרשן האריסטוטלי המהולל אממוניוס הרמיה, פירש פילופונוס את אריסטו בביקורתיות לאור האידיאליזם הנאופלטוני והתיאולוגיה הנוצרית; לפיכך, הוא זיהה את תפיסתו של אריסטו את הגורם הראשון עם התפיסה הנוצרית של אל אישי. מתוך טיעון לדוקטרינת הבריאה הנוצרית, הוא חיבר מסה, שאבדה כעת, "על נצח העולם", בניגוד לפרוקולוס הניאופלטוניסטי מהמאה החמישית.
יתכן שההתנצרות של פילופונוס בתורת אריסטוטל איפשרה לאקדמיה באלכסנדריה להמשיך למרות ביקורת מצד הכנסייה. בין פרשנויותיו הבולטות ניתן למצוא את אלו על המטאפיזיקה של אריסטו, את התהליכים ההגיוניים של האורגונון, הפיזיקה, שלושת ספרי דה אנימה ("על הנשמה"), ו"הדור החיים "(" על דור החיות "). בתיאולוגיה הפילוסופית הוציא פילופונוס את עבודתו העיקרית, Diaitētēs ē peri henōseōs ("מתווך, או בנוגע לאיחוד"), בו הוא דן בשילוש הקדוש ובכריסטולוגיה. מכיוון שהוא קבע כי כל טבע הוא בהכרח אינדיבידואלי, הוא הגיע למסקנה שבמשיח רק טבע אחד אפשרי, האלוהי. אף על פי שעמדה תיאולוגית כזו נראתה כמונופיזיטיות כפירה, פילופונוס קירבה את ההוראה המיאפיזית האורתודוכסית והסבירה כי אף שאנושיותו של ישו נטולת אישיות, היא לא מומשה על ידי האיחוד הבסיסי שלה עם האלוהות. פילופונוס, ביקש את המסורת המיאפיזית של סיינט סייריל מאלכסנדריה (375–444), שהדגיש את אחדות האנושיות והאלוהות של ישו באמצעות הגלגול. משלשדון (451). בשנת 681, כמאה שנה לאחר מותו, הוא הוטל על ידי המועצה השלישית של קונסטנטינופול בגלל מונופיזיטיות לכאורה שלו.
על מנת להגן על הדוגמה הנוצרית של אלמוות אישית, פילופונוס נפרד מהפרשנות האריסטוטלית והסטואית הנפוצה של שכל מוח אוניברסאלי פעיל בכל האנשים, ולימד שלכל אדם יש אינטלקט אינדיבידואלי. בין יתר תרומותיו המקוריות למחשבה המערבית היה פיתוחו של תיאוריית התנועה הקינטית של אריסטו (העיקרון ששום דבר לא זז אלא אם כן הוא מועבר על ידי כוח חיצוני), על ידי אישור שהמהירות פרופורציונאלית ישירות לעודף הכוח להתנגדות. שני עבודות הדקדוק של פילופונוס שונו בהמשך בלקסיקון וקיבלו הכרה רחבה במהלך ימי הביניים.
