תחת מערכת הנאמנות של האו"ם שהוקמה לאחר מלחמת העולם השנייה, היו לצרפתים חובה להעביר את טוגו לעבר ממשל עצמי. דגל מקומי אומץ בשנת 1956, זמן קצר לפני שהמדינה הוקמה לרפובליקה אוטונומית בתוך האיחוד הצרפתי. הרקע הירוק של הדגל עמד על חקלאות, תקווה ונוער; הטריקולור הצרפתי בפינת ההניף העליונה היה תזכורת לאדון האדון הצרפתי. שני כוכבים צהובים עם חמש מחוונים, מסודרים על קו אלכסוני דמיוני העובר מהניף התחתון לזבוב העליון, התייחסו למישורי החוף של הדרום ולסוואנות הצפון, "מאוחדים באהבת סדר ועבודה."
ב- 27 באפריל 1960, טוגו הפך לעצמאי תחת דגל חדש לחלוטין; זה הפחית את שני הכוכבים לאחד בכדי להדגיש את האחדות הלאומית. חמש הפסים הירוקים והצהובים של הדגל תואמים את אזורי המינהל במדינה, ואילו הצבעים הללו הם תזכורת לכך שרובם המכריע של האוכלוסייה תלוי בארץ לצורך קיומה (ירוק) ועבודה משלה לפיתוח (צהוב). אומרים שהקנטון האדום עומד לאהבה, נאמנות וצדקה, ואילו הכוכב הלבן קשור לטוהר. אותם צבעים אדומים-צהובים-ירוקים פאן אפריקאים נבחרו על ידי מספר מדינות אחרות שקיבלו עצמאות זמן קצר לפני או אחרי טוגו.
