הסמל המסורתי המוביל של בורונדי היה תוף עתיק, קרינדה, שהיה בעל מעמד למחצה. המוואמי ("שליט") בלבד יכול היה לפרש את מסרי קרינדה ולהפוך אותם לכללים השולטים בחברה. קריאנדה נבחרה אפוא כסמל לדגל הלאומי כאשר בורונדי הגיח משלטון קולוניאלי בלגי. הוצג גם צמח סורגום, המייצג תוצרת חקלאית ראשית של בורונדי. התוף והצמח הופיעו בדיסק הלבן המרכזי של הדגל שהוסמך על ידי המוואמי ב- 30 במרץ 1962 והניף ב -1 ביולי כאשר הושגה עצמאות.
רקע הדגל כלל שילוב לבן מלבן, רעיון עיצובי שאולי הושאל מבלגיה (הולנד הספרדית), שצלב בורגונדי היה מוטיב דגל נפוץ מהמאה ה -17. צבעו הלבן של המלוחית והדיסק המרכזי סימלו את השלום. השטחים הנותרים היו אדומים, למאבק העצמאות וסבל האומה, וירוקים, לתקוות שהועמדו על פיתוח עתידי. לאחר שהופלה המלוכה בנובמבר 1966, קריאנדה הורחק מהדגל. עיצוב חדש, אשר אושר לאחרונה על פי הצו מיום 27 בספטמבר 1982, הפך לרשמי ב- 28 ביוני 1967. שלושת הכוכבים שש הנקודות האדומות עם הגבולות הירוקים תואמות את המוטו הלאומי, "אחדות, עבודה, התקדמות." עם זאת, עבור רבים הם ללא ספק זוכרים את שלוש הקבוצות האתניות העיקריות של בורונדי - הטוטסי, הוטו וטווה - ואת הנאמנות שבורונדים התחייבו פעם לאל, מלך ומדינתם.
