אינדיגו, צבעי מים חשובים וערכי ערך, הושגו עד 1900 בערך מצמחים מהז'אנרים אינדיגו fera ו- Isatis. אינדיגו היה ידוע קדמיהם של אסיה, מצרים, יוון, רומא, בריטניה ופרו. הוא משמש בארצות הברית בעיקר לצביעת כותנה לבגדי עבודה; במשך זמן רב שימש לייצור גוונים כבדים (כחולים כהים) על צמר.
צבע: אינדיגואידים
בדומה למלנינים, תרכובות האינדיגו הינן תמצית פירוק מטבולית מופרשת אצל בעלי חיים מסוימים. אבל, בניגוד למלנינים, שלהם
קודמו של אינדיגו המופיע באופן טבעי הוא אינדיאני, חומר חסר צבע, מסיס במים, שמוזרק בקלות לגלוקוזה ואינדוקסיל; האחרון מומר לאינדיגו על ידי חמצון קל, כמו חשיפה לאוויר.
המבנה הכימי של אינדיגו הוכרז בשנת 1883 על ידי אדולף פון בייר; תהליך ייצור ריאלי מבחינה מסחרית היה בשימוש בסוף 1890. השיטה, שעדיין נמצאת בשימוש ברחבי העולם, מורכבת מסינתזה של אינדוקסיל על ידי מיזוג של נתרן פניל-גליצינט בתערובת של סודה קאוסטית וסודהמיד.
ניתן להמיר אינדיגו למספר רב של תרכובות פשוטות יותר, אך התגובה הכימית היחידה בעלת חשיבות מעשית היא צמצומה ללוקואינדיגו הצהוב המסיס, באיזו צורה היא מוחלת על סיבי טקסטיל ומחמצת מחדש לאינדיגו.
סגול טייריאן, צבע שצבעו חשיבות רבה בעת העתיקה, הושג מהפרשת חילזון ים (Murex brandaris) הנפוץ בים התיכון. המבנה שלו דומה מאוד לזה של אינדיגו. הוא מעולם לא הופק באופן סינטטי על בסיס מסחרי.
