משקעים אותנטיים, משקעים בים עמוק שנוצר במקום על קרקעית הים. המשקעים האותיגניים המשמעותיים ביותר באגני הים המודרניים הם משקעים עתירי מתכת ונודולי מנגן. משקעים עשירים ממתכת כוללים אלה המועשרים ברזל, מנגן, נחושת, כרום ועופרת. משקעים אלה נפוצים במרכזי התפשטות, ומעידים כי תהליכים במרכזים אחראיים להיווצרותם - באופן ספציפי, זרימת הידרותרמיות היא הגורם השולט.
ליבות מקדחות בים עמוק חשפו את נוכחותן של משקעים עשירים ממתכת על גבי קרום אוקיאני קדום הרחק מקרונות הרכס. ניתן להסיק מכך כי התהליכים השולטים על היווצרותם היו קיימים בעבר, אך עם וריאציות. איזה סוג של משקעים מועשרים מופקד תלוי במידת הערבוב בין המים ההידרותרמיים בעומק הקרום במרכז התפשטות לבין מי הים הקרים המסתובבים לתוך הקרום. ערבוב מועט מייצר סולפידים, ערבוב ליברלי מניב חומר קרום עשיר במנגן, ותנאי ביניים מעוררים משקעים מועשרים בברזל ומנגן.
נודולי מנגן הם חלוקי נחל או אבנים בגודל אגוזי מלך הבנויים משכבות דמויות בצל של מנגן ותחמוצות ברזל. המרכיבים הקטינים כוללים נחושת, ניקל וקובלט, מה שהופך את הגושים לכדי עפרות פוטנציאליות של יסודות יקרי ערך אלה. כריית גושי מנגן היה נושא המחקר והניסוי מאז שנות החמישים. הגוזלות צומחות לאט מאוד, בערך 1 עד 4 מ"מ (0.04 עד 0.15 אינץ ') למיליון שנים. הם נמצאים באזורים של שקיעה איטית, בדרך כלל 5 מ"מ (0.2 אינץ ') לאלף שנים ומטה. בצפון ובדרום האוקיאנוס השקט יש את הריכוז הגדול ביותר של נודולי מנגן; במקומות מסוימים הכיסויים מכסים 90 אחוז משטח קרקעית האוקיאנוס. כיסויים לגובה זה נמצאים גם בדרום האוקיאנוס האטלנטי הדרומי ביותר. קרקעית האוקיאנוס ההודי נטולת ברובה גושים של מנגן. מכיוון שמי ים רוויים במנגן, המשקעים הישירים של היסוד על משטח זמין הם המצב הסביר ביותר להיווצרות גושים.
שתי תעלומות משמעותיות מקיפות גושים של מנגן. קידוחים וביצועים בעמודה המשקעית הראו כי גושים נמצאים בשפע בהרבה בקרקעית הים מאשר מתחתיה וכי קצב צמיחתם של גושים הוא איטית פי 10 משיעורי המשקעים הידועים ביותר. אם זה המקרה, יש לקבור את הגושים במהירות ולהיות נפוצים במשקעים מתחת לפני הקרקע. תיאוריות עכשוויות להסבר תצפיות אלה מציעות שזרמים תחתונים שומרים על אזורים של צמיחת נודלת נקיים מתמצית משקעים וכי אורגניזמים חופרים דוחפים ומגלגלים את הגושים בתהליך האכלה ובכך שומרים אותם על פני קרקעית הים. תצפיות בים העמוק תומכות בשני ההסברים.
